2001年5月23日，國務院發布《農業轉基因生物安全管理條例》。在該《條例》公布后不久，國務院法制辦方面就叫停了轉基因生物安全立法工作。給出環保部的說法是，《農業轉基因生物安全管理條例》與《轉基因生物安全法》存在交叉和沖突。

環保部聯合了科技部、國家林業局、中國科學院等十多個多部門，試圖說服國務院法制辦的相關負責人，但最終無果。

此后，國務院建立了農業轉基因生物安全管理的部際聯席會議制度，參與者包括農業、環保、衛生和檢驗檢疫等部門。但在實際執行當中，特別是在轉基因生物安全問題上，基本上都是農業部說了算。

再往后，業內一些專家開始公開表示，我國轉基因方面的立法主要集中于狹義的農業種植業領域，在環境安全和食品安全的問題上，環境部和衛生部等部門才更具權威性；環境部、科技部、衛生部等部門也都積極要求發出更多的聲音。農業部顯得比較孤立，受到了諸多質疑。

受此影響，2005年春節之后，環保部再次獲準起草《轉基因生物安全法》，但受國務院法制辦的安排，由原來的環保部單方面起草改為環保部與科技部聯合起草。

聯合起草帶來的結果是，立法重新啟動不久，環保部與科技部就在立法觀點上出現了不可調和的矛盾，環保部強調必須從生物安全、環保的角度立法，而科技部卻主張更應該從促進生物技術進步的立場去把握。環保部與科技部都堅持各的觀點，最終使得立法再次停滯下來。

一波三折，在農業部給轉基因水稻、玉米頒發安全證書之后，由于對轉基因生物安全立法的呼聲高漲，相關立法才再次入軌。

艱難推進

對于轉基因生物安全立法的重新啟動，前述知情人士并不看好。他表示，環保部和科技部們之間存在的分歧依然還在，再加之其他相關部門也有分歧，何時能夠完成《轉基因生物安全法》草案很難確定，至于頒布時間則更是遙遙無期。

中央民族大學生命與環境科學學院首席科學家薛達元是國內轉基因生物安研究專家之一，在轉基因生物的安全問題上，他非常擔心相關政府部門的管理跟不上，但他明確表示不看好新一輪的轉基因生物安全立法。

去年9月17日環保部發布了《中國生物多樣性保護戰略與行動計劃（2011-2030年）》（下稱“計劃”），薛達元是該計劃的專家組組長。他曾表示，環保部在制定計劃過程中受到了很大阻力。

薛達元表示，“行動計劃”草案中本來很明確地說轉基因生物存在潛在的風險，最開始的草案中的提法更為嚴重，但是由于有關部門不同意，在正式發布的文本里都被刪掉了，最后剩下的只有關于風險的一點兒表述。

自農業部2009年給轉抗蟲基因水稻和轉基因玉米發放安全證書后，關于轉基因生物安全的爭議聲浪一直持續不斷，而爭議的焦點就是集中在轉基因生物的生物安全問題上。農業部一直反對強調轉基因生物存在潛在的風險。

前述知情人士表示，當前重要的是，要確保本輪轉基因生物安全立法進展順利，就必須先做好農業、衛生和環保三部門的分工，避免管理的交叉或管理真空現象的發生。