紫金礦業集團總裁羅映南表示，此次事件不僅有自然因素，也存在一定管理上的問題。此外，羅還針對有媒體披露的378萬斤中毒魚群數據進行反駁，稱實際應為58萬斤，并表示目前已對死魚和活魚分別以6元/斤和12元/斤進行收購，而該收購資金先由當地政府墊付，等事故責任認定后，再由公司付款給政府。

按照羅映南的描述，紫金山金銅礦在施工管理、生產管理和環保安全管理方面存在不足和一定問題，同時對事件的嚴重性估計不足、相關設施的設計和突發事故的應急預案方面也存在缺陷，故產生如此嚴重后果。

然而，有知情人士透露，早在6月22日左右，上杭縣政府就開始向漁民收購死魚和活魚，并要求漁民不準對外宣揚。直至7月3日，滲漏事故被媒體曝光。

上述人士稱，這意味著實際發生滲漏事故時間，應比媒體曝光的時間還要早。但此說法并沒有得到當地政府證實。

根據福建省環保廳公布的初步調查結果顯示，7月3日15時50分左右，銅礦濕法廠崗位人員發現儲存待處理的污水池水位異常下降。調查發現，污水池中酸性廢水(主要含銅、硫酸根離子)外滲，通過排洪涵洞排入汀江。

此外，對于此次重大污染事件，福建當地媒體“集體失聲”的現象，上述知情人認為，這與紫金礦業背后龐大的國有資本存在莫大關系。

據紫金礦業2009年年報顯示，其第一大股東為上杭縣國資委旗下的閩西興杭國有資產投資經營有限公司，占比28.96%。其第二大股東則為陳發樹的新華都集團，占股11.69%。

紫金山銅礦是紫金礦業旗下最大的銅礦，目前，紫金（銅）礦探明黃金儲量約200噸，探明銅儲量約200萬噸，是紫金礦業的利潤中心之一。