第一階段 2009年2月-4月中旬
修正和完善挑選標準，根據標準篩選、確定候選開發區名單
國家級候選開發區的篩選：把全國范圍內的國家級開發區（包括各個國家級經濟開發區、高新技術開發區、保稅區）分為東部、中部、西部三個部分，納入到候選開發區名單中來，向候選開發區發放評選邀約，按參選要求填寫數據并交組委會；
省級候選開發區的篩選：把全國范圍內的省級開發區劃分為6個區域，按參選要求填寫數據并交組委會。
（注：國家級開發區數據與省級開發區數據填報不一樣）
第二階段 2009年4月下旬
省級百強開發區的產生
組建由區域經濟記者組成的媒體評審團，與學術支持機構及相關專家一起評出省級開發區百強。十大最具投資潛力省級開發區從入圍的省級開發區百強中產生。
第三階段 2009年5月15日前
專家評審階段
成立專家評審團，由專家根據數據進行打分，綜合專家評審團計分結果，最終產生“十大最具投資潛力國家級開發區”榜單、“十大最具投資潛力省級開發區”榜單及若干單項獎。
十大最具投資潛力國家級開發區的產生：根據候選開發區填報的數據，由專家根據數據進行打分。綜合專家評審委員會計分結果，最終產生；
十大最具投資潛力省級開發區的：公布最具投資潛力省級開發區百強榜并向入圍開發區征集評選數據；由專家根據數據進行打分。綜合專家評審委員會計分結果，最終產生。
第四階段 2009年6月6日
頒獎典禮及后續推廣階段
2009年4月將在北京舉辦隆重的 “中國最具投資潛力開發區”評選頒獎典禮。當選開發區負責人將受邀出席論壇并發表演講。百余位各級領導、著名學者、老一輩開發區創建開拓者、世界500強企業高管、香港及各地知名企業負責人將出席論壇。會后將組織有特色的分論壇。
